学校始建于1947年，于1995年6月27日经原国家教委批准，由佳木斯医学院、佳木斯工学院、佳木斯师范专科学校和原佳木斯大学合并组成；2000年后，佳木斯市粮食职工中等专业学校、富锦师范学校、黑龙江省理工学校相继并入。
佳木斯医学院。
佳木斯工学院和佳木斯医学院相比佳木斯工学院级别高，因为佳木斯工学院是一所一本学校，是黑龙江省重点建设的省属高水平大学，而佳木斯医学院只是一所普通的公办二本学校，所以佳木斯工学院和佳木斯医学院相比佳木斯工学院级别高。
佳木斯大学不是211工程高校。
佳木斯大学（Jiamusi-University），位于黑龙江省佳木斯市，是黑龙江省重点建设的省属高水平大学，是“十三五”期间“国家百所中西部高校基础能力建设工程（二期）支持高校”，为高等教育学会医学教育专业。
1、综合大学：佳木斯大学（由原来医学院、工学院、师范学院、老佳木斯大学97年合校而成）。
2、专科学校：黑龙江中医药大学（属于哈尔滨分校）、 黑龙江农业技术职业学院 、黑龙江省三江美术学院（私立），黑龙江商业学校。
佳木斯。
佳木斯师范专科学校成立于1949年，原为佳木斯师范学校，1978年升格为佳木斯师范专科学校；佳木斯工学院成立于1958年，是黑龙江省第一所以农机专业为主的工科本科院校；原佳木斯大学成立于1985年，为市属地方职业大学。