标记基因是帮助对转基因生物工程体进行筛选和鉴定的一类外源基因，包括选择标记基因和报告基因。
在选择压下，不含标记基因及其产物的非转化细胞和组织死亡，转化细胞由于有抗性而可以继续存活。
常用的选择标记基因有抗生素抗性基因。
1、什么是标记基因:标记基因就是载体上的一个记号，用来检测目的基因是否成功导入受体细胞。
2、机理是：前提目的基因，标记基因都在质粒上，只要知道标记基因进入受体细胞就证明质粒也进入受体细胞了，又因为目的基因也在质粒上。
作用如下：1、标记基因是一种已知功能或已知序列的基因，能够起着特异性标记的作用；2、在基因工程意义上，它是重组DNA载体的重要标记，通常用来检验转化成功与否；3、在基因定位意义上，它是对目的基因进行标志的工具，通常用。
标记基因主要指一些已知的编码产物容易被人们检测的gene，比如荧光蛋白基因，抗生素抗性基因等，主要就是加在目的基因前后，用来检测目的基因是否表达
是指已知功能或已知座位的基因。
在基因工程中使用与选择重组体dna转化细胞的基因；在基因定位中是指定位在染色体或其它载体上的基因以作为其它基因定位的标记。