上游引物就是和要扩增基因片断上游序列结合的引物（引物就是单链寡聚核苷酸，基因扩增需要从引物开始），同理，下游引物指与目的基因片断下游序列结合者。
具体示意如下：（上下两条长线代表DNA模板）5'---3'(无法控制输入格式。
上游引物：DNA分子两端不一样，因为核苷酸分子不是对称的，5'位有个磷酸，3'位是-OH就是：磷酸端和羟基端。
DNA复制总是从5’端到3’端，因为DNA聚合酶只能往3’端加核苷酸。
所以谁先复制谁上游，往后的就是下游，上游。
上游引物就是和要扩增基因片断上游序列结合的引物（引物就是单链寡聚核苷酸，基因扩增需要从引物开始），同理，下游引物指与目的基因片断下游序列结合者。
具体示意如下：（上下两条长线代表DNA模板）5'--- 3'(无法控制输入格。
上游引物：Forward primer,F-引物,又称为正向引物；下游引物：Reverse primer,R-引物,又称为反向引物.